Melanotan-II ima slabu topljivost u vodi, ali pokazuje dobru topljivost u organskim otapalima kao što su dimetil sulfoksid (DMSO) i N,N-dimetilformamid (DMF).
U praktičnim primjenama, ako je otapanje potrebno u eksperimentalne ili terapeutske svrhe, prvo se može otopiti u DMSO-u da se pripremi temeljna otopina visoke-koncentracije i zatim razrijediti odgovarajućim puferom (kao što je fiziološka otopina ili fosfatno-puferirana fiziološka otopina). Međutim, mora se voditi računa o kontroli konačne koncentracije DMSO-općenito držeći je ispod 0,1%-kako bi se izbjegli toksični učinci na stanice ili organizam.
U području estetike Melanotan-II privukao je široku pozornost zbog svoje sposobnosti da inducira proizvodnju melanina i potamni kožu. Brojna su istraživanja usmjerena na procjenu njegove učinkovitosti i sigurnosti u zaštiti od sunca i kozmetičkoj uporabi.
